医学论文生存曲线制作

在有关差异表达基因和生物标志物模型分析中，经常会见到生存曲线分析。如下图所示，生存曲线是文献中常见的分析图，结合临床数据，可以验证某个基因或模型作为疾病复发诊断和预后标志物。 那么如何使用Graphpad绘制生存曲线呢？我们就以下图为例，来一步步演示吧。 Graphpad绘制生存曲线的操作视频，附bilibili高清视频链接： 以下是图文版教程。 绘制生存曲线需要生存时间、生存状态、基因表达量和分组信息，将数据整理成表格。示例文件如 示例数据.xlsx 所示，选择time、status、risk三列数据进行分析。 （1）patient：患者编号；（2）time：生存时间；（3）status：生存状态，其中0表示存活，1表示死亡；（4）expression：基因的表达量（或模型的风险评分）；（5）risk：按照基因表达量（或模型的风险评分）高低分成2组，这里0表示表达量低的组，1表示表达量高的组。 接下来，打开 Graphpad ，选择 Survival ，点击 Create 。 将Excel中相关的数据复制到Graphpad中。 点击 Results 中 Survival of Data1 的 Curve comparision ，其中 Log-rank (Mantel-Cox) test 中的 P value 就是我们需要的p值。 点击 Graphs 中的 Data 1 ，选择其中第一种图 Staircase with ticks ,在 Show result as: 中选择 Fractions ，点击 OK 。 双击坐标轴，修改相关参数。点击 X axis ，取消选择 Automatically determine the range and interval 。修改 Minimum （x轴最小值）、 Maximum （x轴最大值）和 Major ticks interval （坐标间隔）。 双击绘图区域，在 Data set 中选择 Survival of Data 1:Survival proportions:low ，首先点击 Graph Settings ，选择第2个图 Point to point, no error bars 。返回 Appearance 修改 Shape （形状）、 Border color （颜色）、 Border thickness （线宽）、 Show legend （图例）等参数；将 Data set 修改成 Survival of Data 1:Survival proportions:high ，修改相同的参数。 修改图片和坐标轴标题，将图例移动到合适的位置，生存曲线图就绘制完成了。