发表论文学校和单位不一样

这个不是根据期刊要求，而是根据你发文单位的要求举例：你要保研，保研单位会出一个官方文件，要求署名单位必须为：XXX大学在这种情况下有学院，也不写学院。所以根据发布的文件来

这要看投稿的形式，如果是个人署名发表，属于个人行为，写不写无所谓，写是为了自己身份增大发表几率。假如论文有超高的价值，写不写单位都会被发表。如果论文属于学校的科研项目（或申报学校成果），则必须填写学校名称。

可以呀这是允许的

和学校评定准则有关，不同学校有不同的要求。至于你的顾虑，我还没有听说有学校这么做。以我的学校来说，学校任第一、二作者为同一个积分，这是因为通常学生为第一作者，第二作者必然写自己的导师，比如一篇CSCD核心为150分，CSCD扩展为80分，普通的双核为20分，等等。我不明白你的论文第二作者为什么不写自己导师呢？