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生物测序毕业论文

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生物测序毕业论文

我最近刚好写过一篇这样的文章,不过字数没那么多,希望可以让过关! 生物与软件 关键词 :先进、互补性、前景、综合国力、造福人类 摘要 :生物与电子计算机技术的融合是时代的趋势,将开创光明的未来,造福人类。 正文 : 事物正确的发展趋势是与当代最主流的先进事物相融合,从而达到普及,使整个人类向前跨步。 自从比尔·盖茨建立了微软帝国,开创了个人电脑的时代,世界的全面信息化就变的不可避免。而生物学作为现今最热门及将来最有前途的科学,将不可避免的与电子计算机科学相互融合,互取其长。 于1984年7月在联邦德国西柏林召开的第14届国际植物学大会总结了植物学总的三点发展趋势,其中就有“以电子计算机为手段的数学模拟方面的研究和系统分析方面的研究”。生物软件初现雏形。 两者的互补性 : 现在计算机操作系统及各种软件的运行都是按照一定的程序进行的,而人体的各种新陈代谢也是按照既定的各种程序进行的。而且,就现在来说,人类体内的调控系统,即人类自身具有的在亿万年进化中逐渐接近完美的程序,比起现在的计算机内的程序是有过之而无不及的。它具有更大的可调控性等优势。人类以后计算机的研制要借鉴生物自身具有的各种调控程序,而这种方面的研究也已经开始,如生物计算机,及对人体大脑的解密而正在研制的智能计算机。 相比之下,人类生物学的研究也离不开电子计算机技术的发展。例如现在生物学的发展已经进入分子生物学时代,而由于电子计算机技术的发展,很多生物科学研究方面的软件也应运而生,它极大地减少了科学家及生物公司技术工人的工作量,提高了效率,增加了收益。例如在基因工程中就会常用到很多生物软件,现简介一种: Omiga :主要功能:编辑、浏览、蛋白质或核酸序列,分析序列组成。用Clustal. W进行同源序列比较,发现同源区。实现了核酸序列与其互补链之间的转化,序列的拷贝、删 找核酸限制性酶切位点、基元(Motif)及开放阅读框(ORF),设计并评估PCR、测序引物。查找蛋白质解蛋白位点(Proteolytic Sites)、基元、二级结构等。查寻结果可以以图谱及表格的显示,表格设有多种分类显示形式。利用Mange快捷键,用户可以向限制性内切酶、蛋白质或核酸基元、开放阅读框及蛋白位点等数据库中添加或移去某些信息。每一数据库中都设有多种查寻参数,可供选择使用。用户也可以添加、编辑或自定义某些查寻参数。可从MacVectorTM、Wisconsin PackageTM等数据库中输入或输出序列。另外,该软件还提供了一个很有特色的类似于核酸限制酶分析的蛋白分析,对蛋白进行有关的多肽酶处理后产生多肽片段。 实际上,大部分对核酸蛋白的序列分析功能,在Omiga 中都能找到;而且界面非常友好。Omiga作为强大的蛋白质、核酸分析软件,它还兼有引物设计的功能。 当然,Omiga还有很多同类软件。如日立软件公司(Hitachi Sofeware Engineering Co.,Ltd.)97年推出的DNASIS ,加拿大的Premier公司开发的Primer Premier 等。 发展前景 : 生物软件具有很有的兼容性,可以支持现在的操作系统。 生物软件、芯片具有专利性,是典型的知识经济时代的产物。具有专利性的物品,出卖的是智力,是现在具有知识武装的大学生创业的重要方面。 我们来看一组关于生物软件产品的售价: 基因芯片综合分析软件ArrayVision :售价6900美元 供应BI-2000医学图像分析系统 48000元(人民币)/套 显微镜自动平台系统 5800元(人民币)/套 Paup 一种功能强大的商业版系统进化分析软件,价值数千美金。 由此我们可以看出生物软件是一个相当大的产业,新的产业造就新的财富,新的财富将由新人来获得,而具有生物与电子计算机技术的新一代大学生,无疑将充当这群去创造新财富的新人。 意义及作用 : 当今世界,国与国之间的竞争,不仅是军事实力的竞争,更是综合国力的竞争。而科学技术的竞争在当今日益知识化信息化的世界显得尤为重要,因而也就成为综合国力竞争中极其重要的方面。生物科学作为现今最热门及将来最有前途的科学,其重要性更是不言而喻。再有,现代社会中,电子计算机已经逐渐占据了主流地位。所以,生物与计算机的融合是时代的必然。而生物软件就是这两者最直接的结合。所以,生物软件的发展程度是一个国家综合国力的体现,谁如果在这方面领先于世界,那必将引领时代的潮流。反之,谁如果在这方面掉以轻心,将来必受制于人。 在当今世界日益重视身体健康的情景下,生物与计算机的结合必将造福人类。 由此观之,生物软件的发展是时代的趋势,而我们这一代,将是这趋势的创造者。我们大有前途。

测序员毕业论文

毕业论文答辩决议书范文(通用10篇)

艰苦的大学生活即将结束,大学毕业前都要通过最后的毕业论文,毕业论文是一种比较正规的、比较重要的检验学生学习成果的形式,那么应当如何写毕业论文呢?下面是我帮大家整理的毕业论文答辩决议书范文,希望能够帮助到大家。

复旦大学硕士研究生XX的学位论文《XXXXX》从单核苷酸多态性(SNP)和拷贝数变异(CNV)两个不同的遗传学研究角度对中国人痛风遗传变异进行深入研究,发现了4个新的痛风易感候选基因,并分析了遗传异质性因素对于遗传因素和痛风易感性关联的影响,从尿酸排泄和炎症反应两个痛风发生的生理过程部分解释了痛风的发病机制。

当前,随着痛风/高尿酸血症研究的不断深入,遗传因素对于疾病发生中的作用越来越受到重视。本论文进一步在中国人群中探讨了遗传因素对于痛风易感性的作用,为今后的诊断和防治提供了宝贵的信息。

本论文立题有一定新意,论文工作量饱满,结构合理,逻辑结构清晰,文字表达清晰,图标清楚,达到硕士研究生学位论文要求。在论文答辩中,该生思路清晰,表达准确,较为清楚地回答了委员们提出的问题。因此,答辩委员会认为XX同学具有扎实的基础理论和系统的专业知识,具备了从事本学科的科学研究工作的能力。

经过答辩委员会讨论和无记名投票,一致通过XX同学的硕士论文答辩,建议授予XX同学硕士学位。同时答辩委员会一致认为学位论文。《XXXXX》是一篇优秀的硕士学位论文。

xxxx大学xxx学院xxx专业研究生xx所完成的题目为“”的学位论文,选题适当,具有较深的理论意义和广泛的实用价值。作者系统地归纳和综合地评述了有关文献,掌握了该领域内的研究现状和发展方向。本文作者通过大量的文献阅读和亲身的实践经验研究了一种基于xxxx的xxxxx法,完成了对xxxxxx,并设计出了xxxxxxx系统。

论文取得了下列研究成果:

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2、研究并设计了基于法的xxxxxxx电路。由于采用该种方法不需要xxxxxxxx电路,因此,解决了传统的xxxxxxx等问题。

3、研究并设计了基于的xxxxxx硬件电路。其中,包括对控制电源、单片机外围电路、驱动电路、逆变电路以及保护电路的设计等,并在硬件电路设计中考虑了软硬件抗干扰措施。

4、介绍了在xxxxxxxx模式下的常用的xxxxxxx方法,详细分析了xxxxxxxx控制中最常用的xxxxx技术,并编写出了程序,使xxxx能够顺利xxxxxxxx。

5、完成了控制系统的调试工作,其中包括硬件电路的调试和整个系统的软硬件联调,最后给出了系统调试结果。

论文工作表明作者已经掌握本学科扎实的理论基础和深入系统的专业知识,独立从事科研工作能力强。论文结构合理,论述清楚,逻辑性强,已达到学术硕士学位论文的要求。

答辩过程中表达清楚,回答问题正确。答辩委员会一致同意通过答辩,并建议授予其学术硕士学位。

系统性红斑狼疮和类风湿性关节炎都是由基因和环境因素相互作用的、临床表现复杂的自身免疫性疾病。被用于研究PTPN22基因多态性与云南汉族系统性红斑狼疮和类风湿性关节炎的相关性。

论文采用2个群体(SLE,RA),应用PCR—RFLP和直接测序的方法,对PTPN22基因7个SNPs(rs1217414,rs1217418,rs3765598,rs1746853,rs2470601,rs1970559,rs3811021)多态进行检测,并对检测结果采用、、HaploView软件进行数据统计分析。并对各个位点的多态与系统性红斑狼疮和类风湿性关节炎相关性进行讨论。得到如下结果:

1、PTPN22基因C1858T位点在云南汉族人群中无多态性。内含子rs1217414,rs1217418,rs1746853多态性可能与云南汉族SLE,RA相关。内含子rs1970559与云南汉族SLE,RA无关。rs3765598和rs3811021位点突变可能与云南汉族系统性红斑狼疮相关,rs3811021位点突变可能与云南汉族类风湿性关节炎相关。

2、rs1217414,rs1746853,rs3811021位点突变与系统性红斑狼疮各临床指标无关。rs1217418突变可能与WBC有关,rs1970559可能与BUT,WBC有关,rs3765598可能与抗ANA1和抗ANA2抗体有关。

3、单倍型(CATTCT)为主要单倍型。单倍型(CAGTCC),单倍型(CATTCC)和单倍型(TATTCT)显著降低系统性红斑狼疮风险性(PPAGTTC)

论文选题新颖,有一定创新性,实验设计和实验结果科学。论文内容丰富,写作规范,逻辑清晰,结构合理。答辩回答问题正确,思路清晰,已达到硕士研究生水平,一致通过答辩,建议授予理学硕士学位。

xxx同学采用实验研究法, 通过干预社区脑卒中患者的功能锻炼, 探讨以保证脑卒中患者肢体功能得到更大程度的恢复, 身体状况得到 更大的改善为最终目标, 寻找一种高效的功能锻炼指导模式, 确保社 区居家脑卒中患者能够获得系统、规范、连续的功能锻炼指导,为其 进一步康复提供保证。 使出院脑卒中患者能在住院治疗后的恢复期中 得到持续的卫生保健服务, 最大程度的重建患者肢体功能, 预防再复 发。同时,该探究将有利于节约社区卫生服务成本,提高社区医护人 员对于脑卒中管理的效率及效果,最终产生良好的经济社会效益。 该论文选题鲜明,具有实用性,研究设计较合理,所得数据真实 可信, 统计方法使用得当, 结果分析较深入, 论文撰写格式符合要求, 该论文已达到硕士学位论文的要求。 该生在论文答辩中回答问题实事求是, 思路清晰。 经答辩委员会 无记名投票,一致通过论文答辩,并建议授予医学硕士学位。

答辩委员会主席:

xxxx年xx月xx日

XX 同学的硕士学位论文《XXXXXXXXX》 ,选题紧跟我国禁烟控烟 的热点话题,科研设计简单合理,具有一定的理论价值和现实意义。 依据世界卫生组织发布的 《烟草控制框架公约》 和近 5 年来发布的 《中 国控制吸烟报告》 ,确定预防的重点对象是年轻的大学生群体,在文 献研究和时事动态分析的基础上, 对高校大学生吸烟与被动吸烟现况 进行了横断面调查研究,以及详细分析了其各自的影响因素。 论文内容真实,层次分明,逻辑性强,图表清晰度有待加强,论 据比较充分,数据准确,资料详实,统计学处理正确,结论可靠。 答辩时的论述符合一般逻辑,能够正确回答问题,论文表明作者 掌握了社会医学与卫生事业管理专业的基本理论和医学社会科学研 究方法,知识面比较宽广,拥有较强的独立科研能力。 答辩委员会认为本篇论文达到了硕士学位研究生论文水平, 答辩 委员会委员全体无记名投票通过论文答辩,建议授予医学硕士学位。

本论文主要研究裂褶菌F17锰过氧化物酶的酶学性质,并在单因子分析法的基础上,通过响应面法优化了影响该酶活力的各个因素。同时将研究的结果应用于染料脱色中,发挥其在环境保护中的作用。作者还初步进行了基因克隆实验,并且优化了反应体系,获得了一些序列。这些研究结果对于进一步研究、开发应用锰过氧化物酶具有一定的参考意义。论文立项具有一定的理论意义和实际应用价值。

该论文目标明确,研究路线合理,实验数据翔实,实验结果可信,观点正确。论文书写规范,层次清晰,图表规范。作者答辩表达清楚,回答问题思路清晰,论文已达硕士论文的学术水平。

经答辩委员会讨论评议和无记名方式投票表决,一致通过其毕业论文答辩,建议授予理学硕士学位。

本论文主要探讨了产广谱乳酸菌素菌株的.筛选、鉴定、发酵的全过程。筛选到了一株既可抑制革兰氏阳性菌又可抑制革兰氏阴性菌的乳酸菌,经鉴定是一株植物乳杆菌;又通过摇瓶发酵数据优化了菌株发酵条件;并初步探索了菌株固定化的条件。该论文立意新颖,研究目标明确,数据方案设计较合理,方法可靠。论文研究为进一步探索乳酸菌素的生产条件提供了依据与实验研究基础,具有一定的应用价值。

该论文书写规范,逻辑性强。答辩表达清楚,回答问题思路清晰,论文已达硕士论文的学术水平。

硕士学位论文答辩委员会决议: 分布式视频编码是一种新兴的编码框架, 它可以将计算复杂度从编码端转移 到解码端, 同时具有较好的压缩效率和抗误码能力,非常适合于一些新兴的应用 场合。论文对分布式视频编码中的 WZ 帧编码技术进行了研究,选题科学,具有 较高的理论研究意义和实际应用价值。 论文首先利用统计学的原理分析证明边信息与待解码 WZ 帧之间的较强相似 性,提出以边信息来填充 WZ 帧高频子块的思路,并将其运用到嵌入式分级编码 中,构造出改进的基于 DCT 和小波变换的 WZ 帧编码架构。实验表明,改进方法 与 (帧内编码)、(帧内编码)的性能相当。 论文概念清楚,分析严谨,理论推导正确,做了较多的仿真实验,并对实验 结论作了理论上的阐述和讨论。 论文有创新,表明作者在本专业具有扎实的理论 基础和系统的专门知识,有较强的独立从事科研的能力。答辩时,条理清楚,回 答问题正确。经答辩委员会讨论,一致同意通过硕士论文答辩,建议授予工学硕 士学位。

本文对分级进风燃烧室内的高温气固两相流动与燃烧过程进行了实验研究,对于了解分级燃烧过程的两相流动、燃烧与污染物生成机理,发展分级燃烧技术,具有重要的学术意义和实用价值。

本文取得了以下主要成果:

1)建立了分级进风燃烧室高温气固两相流动热态实验装置系统。

2)应用三维激光粒子动态分析仪对分级进风燃烧室内有气相燃烧的高温气固流动进行了测量,得到了气固两相平均轴向与切向速度和湍流脉动特性以及两相轴向与切向速度的概率密度函数,揭示了燃烧室内高温气固两相流动的特点。

3)对分级进风燃烧室内湍流燃烧的温度场和组分浓度场进行了测量,阐明了二次风率对气体温度场、组分浓度场和NO浓度场的影响规律。

论文表明作者掌握了本学科坚实的基础理论和系统的专门知识,具有独立从事科学研究工作的能力。论文写作规范,图表完备。答辩中叙述清晰,回答问题正确。答辩委员会经表决,5票一致同意通过论文答辩,并建议授予郑晓川工学硕士学位。

速生材改性研究是木材科学与应用研究领域十分重要的课题。论文选题紧密结合学科发展和实际应用需要,具有较强的理论意义和较好的应用背景。立题正确。

作者对国内外在木材改性领域的研究情况和发展趋势做了较充分的调研和分析,在此基础上,有针对性地开展了三倍体毛白杨木材化学改性研究。论文采用4种不同的方法对木材进行化学改性处理,通过尺寸稳定性、阻燃性、抗吸水性、硬度等的检测,考察了各种改性木材的物理力学性能,得出以下主要研究结论:

1)用含有纳米SiO2的UF、PF树脂复合处理剂处理木材时,二氧化硅对提高木

材的尺寸稳定性和硬度具有明显的作用,且纳米二氧化硅能够降低处理材的游离甲醛释放量;2)马来酸酐/苯乙烯和马来酸酐/环氧氯丙烷复合处理液均能够在一定程度上提高木材的尺寸稳定性、抗吸水性、抗吸湿性和硬度。研究成果具有一定的理论意义和实际应用价值。

论文实验设计合理,数据完整,撰写认真,文字流畅,图表清晰,工作量饱满。论文答辩中,讲解重点突出,回答问题基本正确,表明该同学具有较好的本学科理论基础及相关的专业知识,具备了较好的综合分析能力和从事科研工作的能力,论文达到了硕士学位水平要求。

全体答辩评委一致同意通过论文答辩,建议授予工学硕士学位。

随着计算机主频、内存的快速发展,显示清晰度和显示尺寸的限制已经成为计算机系统的瓶颈。如何利用高性能价格比的机群实现超高分辨率的高清晰度大尺寸显示正在成为并行可视化方向一个重要的研究课题。李颖敏同学的硕士论文以设计基于机群的拼贴显示系统提供方便的编程接口和编程环境为目的,其选题具有前瞻性,论文的工作有很好的应用前景。(第一段:选题的意义)

论文在分析调研国际目前研究动态的基础上应用“分布式共享显示内存”的新概念提出了一种并行程序环境下的拼贴显示接口,并以两种形式实现了该接口,简化了系统应用的编程实现。提供了一些测试用的应用程序,为今后的研究工作提供了有参考价值的研究平台。展示了基于机群作分布式显示的良好前景。同时作者还利用该拼贴显示接口为一个地理图像信息系统实现了多屏显示应用,满足了该应用对高分辨率显示的需求。(第二段:论文工作取得的成果或新见解) 论文工作表明作者基础理论和专业知识都比较好,掌握了计算机系统结构领域分析问题、解决问题的基本方法和技能。对拼贴显示领域有较深的了解,对机群系统,尤其是有较好的基础知识和技术,具备了一定的独立工作能力和实际动手能力(第三段:对科研能力及对论文的评价)

论文组织合理,叙述清晰,文字简洁流畅,理论与实践结合得较好。答辩中表达清楚,思维敏捷,能够正确回答问题。经答辩委员会无记名投票,一致通过该同学的硕士论文答辩,并一致建议授予李颖敏同学工学硕士学位。(第四段:答辩中的表现及结论性意见)

一种全新的DNA甲基化研究方法——Pyrosequencing技术DNA甲基化是一种表观遗传修饰,它是由DNA甲基转移酶(DNA methyl-transferase,Dnmt)催化S-腺苷甲硫氨酸作为甲基供体,将胞嘧啶转变为5-甲基胞嘧啶(mC)的一种反应,在真核生物DNA中,5-甲基胞嘧啶是唯一存在的化学性修饰碱基.CG二核苷酸是最主要的甲基化位点,它在基因组中呈不均匀分布,存在高甲基化、低甲基化和非甲基化的区域,在哺乳动物中mC约占C总量的2-7%.一般说来,DNA的甲基化会抑制基因的表达.DNA的甲基化对维持染色体的结构、X染色体的失活、基因印记和肿瘤的发生发展都起重要的作用.CpG双核苷酸在人类基因组中的分布很不均一,而在基因组的某些区段,CpG保持或高于正常概率,这些区段被称作CpG岛.CpG岛主要位于基因的启动子和第一外显子区域,约有60%以上基因的启动子含有CpG岛.CpG甲基化的研究在肿瘤的研究中有着非常主要的地位.通过基因启动子区及附近区域CpG岛胞嘧啶的甲基化可以在转录水平调节基因的表达,从而引起相应基因沉默,去甲基化又可恢复其表达.DNA甲基化在生理情况下就参与了控制基因的时空表达,在肿瘤发生时,肿瘤细胞全基因组低甲基化是一个重要特征.肿瘤细胞基因组甲基化的程度与正常细胞相比仅为20-60% ,同时伴有局部区域基因的高甲基化,包括肿瘤抑制基因、抑制肿瘤转移和浸润的基因、细胞周期调节基因、DNA修复基因、血管形成抑制基因等.但是目前研究手段的局限,限制了DNA甲基化的广泛研究.近年来,研究者不断探索定性及定量检测单个或多个甲基化位点的方法,但由于甲基化多态性区域存在的密度很高,所以对于延伸反应其引物的位置很难设计.Pyrosequencing技术作为一种新的序列分析技术,能够快速地检测甲基化的频率,对样品中的甲基化位点进行定性及定量检测,为甲基化研究提供了新的途径.从原理上来看,Pyrosequencing是一种通过合成方法进行序列分析的方法,它通过核苷酸和模板结合后释放的焦磷酸引发酶级联反应,促使荧光素发光并进行检测.这项技术曾经被用作单核苷酸多态性(SNP)的基因型和单倍型的检测,以及细菌和病毒的鉴定和分型研究.这项技术的一个主要特点是在Pyrogarm™软件上显示的峰值高度来自于序列分析的原始数据,通过峰值的高度可以精确的检测混合DNA模板中等位基因的频率.目前甲基化研究方面,很多甲基化定量分析的报道采用亚硫酸氢盐处理甲基化样本,并用混合的PCR产物 作为校正.其主要原理是:亚硫酸氢盐可以将没有甲基化的胞嘧啶转化为尿嘧啶,而在适当的实验条件下甲基化的胞嘧啶保持不变.因而,用它处理样本后,再进行PCR扩增,甲基化的位点可以被当作一个C/T的SNP来处理,它的基因频率为0-100%.在此,我们给大家介绍一个研究人员使用Pyrosequencing技术分析并精确定量DNA甲基化水平的例子.研究者在一个Pyrosequencing反应中同时检测了6个甲基化位点.这种方法同样可以用于石蜡包埋的组织,并且具有较高的重复性和精确性.实验选择谷胱甘肽-S-转移酶π(GSTP1)转录启动位点的CpG岛进行检测.这些位点在正常前列腺组织中是非甲基化的,而在肿瘤样本中高甲基化.通过PCR扩增一个包含17个甲基化多态位点140bp的片段,并用4个测序引物研究其中15个位点(Table 1).使用在线的SNP测序引物设计软件(Pyrosequencing AB)设计测序引物,其中一些甲基化多态性位点用最可能的碱基所代替,以减少计算的数量.再通过人工检测测序引物可能存在的错配.此外,同时在PSQ 96MA DNA分析仪上运行空白对照,扣除由测序引物、生物素标记的引物或是模板引起的背景.PCR引物设计完全与模板相匹配,不覆盖任何甲基化多态性区域.使用10ng亚硫酸氢盐转化的DNA样本或是10 fmol纯化的PCR产物,10 pmol 正向(5’-GTGATTTAGTATTGG-3’)和反向(5’-biotin-AACTCTAAACCCCATC-3’)引物扩增GSTP1转录启动位点的基因片段,扩增片段长度为144bp.反应体系为60 mM Tris-SO4,pH mM (NH4)2SO4,1 mM MgSO4,200 μM dNTPs,以及3 U Platinum Taq DNA高保真聚合酶,终体积为50μ循环设置:首先在95℃下变性4分钟,然后在95℃ 30S,50℃ 45S以及72℃ 20S条件下重复50个循环,最后一步延伸步骤在72℃下4分钟,中止反应.PCR反应在Eppendorf的Mastercycler 96 哺乳动物基因组中,DNA甲基化是指CpG二核苷酸中的胞嘧啶第5位碳原

浅析现阶段高通量测序中的拼接问题论文

摘要:近年来,随着第二代测序技术的普及和第三代测序技术的逐步发展,高通量测序技术在实际研究中的应用越来越广泛。高速率、高性价比是其主要优点。相对于传统的桑格(Sanger)法测序来言,高通量测序得到的片段长度较为短小,故如何拼接得到完整的序列一直是炙手可热的研究方向。本文总结了现阶段高通量测序中拼接问题的研究结果,针对现在流行的各种算法进行了简单介绍。

关键词:高通量测序;reads 拼接;contigs 组装;OLC、De brujin 图

一、测序技术的发展过程和现状[1]

(一)桑格法

桑格法又叫做双脱氧链终止法,由Sanger在1977年提出。通过加入带有放射标记的dd NTP(双脱氧核苷酸)使DNA合成终止。再通过电泳,并使用放射自显影技术读出碱基。此方法得到的片段较长,能达到1000bp左右。

(二)第二代测序技术

随着科学技术的发展,传统的桑格法已经不能满足研究的需要。科学家们需要更快的速度、更高的通量以及更低廉的价格,于是第二代测序技术应运而生。其核心思想是边合成边测序。现在主要有454 GS FLX、SOLi D和Illumina/Solexa GenomeAnalyzer三个平台。第二代测序是现阶段测序技术的主流,也是高通量测序的开始。

(三)第三代测序技术

第三代测序技术是指单分子测序技术。不需要经过PCR的过程即可测序,速度可以达到每秒十个碱基。通量更大,读长更短,是现阶段测序技术的发展方向。

二、高通量测序中的拼接工作

(一)高通量测序所得片段的特点

高通量测序之后所得到的序列片段称为reads(读取),其主要特点两点。一是长度短,一般在200bp以 下,最长的454平台能达到的长度也不过1000bp,因此需要进行 大量的拼接才能得到整条DNA序列。二是有部分重叠,由于测序位置具有随机性,故各reads总会有一定的重叠,这些重叠是拼接工作的关键。

(二)拼接过程

整个拼接过程分为两步。第一步,考察reads的重复序列,并拼接成更长的片段,称为contigs(重叠群),这一步称为reads的拼接;第二步,确定contigs之间的顺序关系,并按此排列,形成称为scaffolds的序列,这一步叫做contigs的组装。

三、Reads的`拼接

(一)拼接过程的难点

reads拼接过程中要克服的难点主 要有两点,一是高通量测序得到的reads长度较短,故内含信息较少,不易确认相对顺序。二是远程连接信息(Long-range linking information)的不可靠性。 2这两点制约着reads拼接过程的准确率。

(二)方法[3]

reads拼接过程中算法的基本要求是de novo(从头测序),即不需要任何序列信息即可对原料进行测序。由此衍生出两种主流的算法:

OLC,即交叠-排列-共有序列算法(Overlap-layout-consensus),是一个比较传统的算法,其基本思想为根据reads间的重复部分,确定可能性的reads连接顺序。

其步骤为:构建交叠图:对每两个reads进行比对,计算它们的重叠度---排列reads:将reads进行排列,确定它们之间的相对位置,建立overlap图---生成共有序列:通过多序列比对等方法,确立最后的contig.

OLC算法的计算量主要体现在交叠图的构建,而高通量测序得到的海量短序列有大量的交叠,往往需要大量的运算时间。故OLC算法并不适合现在高通量测序的发展趋势。现在某些拼接软件,如Shorty、CABOG等仍在使用基于此的算法。虽然这些软件针对OLC算法有一定的改进和优化,但其拼接速度和准确性仍受到限制。

brujin图

基于De brujin图(DBG)的算法是现在最流行的算法,许多常用的拼接软件如Velvet、ABy SS等都在使用这种算法。其特点为把基因序列的拼接问题转化为了数学上的图论问题,大大提高了拼接效率。

(1)基本思想

reads中 连 续 的k个 碱 基 称 为k -mer,作 为DBG的节点,两个k-mer如 果在同一read中 相邻,则形成一条边。故每个read都会对一些边加权,最后形成一个含有节点、有权值的边的DBG,由此生成最佳的contig.

(2)步骤

筛选reads:对reads进行检测,去除掉可能错误的reads---确定k值:k的值直接影响速度和精度。 K值较大时,精度有所提高,但更容易受覆盖率的影响。故应该根据覆盖率、reads长度等确定合适的k值---处 理DBG:根 据 确 定 的k值,做 出DBG,同时完成化简和修正---根据DBG,拼接成contig.

(3)优缺点

DBG算法在处理海量短reads的时候效果优秀,与现在测序技术的发展趋势相匹配。然而,由于k-mer的长度较短,此方法受重复序列、测序错误的影响较大。

(三)不同拼接软件的效果差异

不同的拼接软件在reads拼接过程中表现为三点:一是比起软件来说,reads质量对拼接结果影响更大;二是与标准序列的接近度随reads和拼接软件的不同有很大改变;三是各软件拼接的正确率差别很大,但与接近度的结果不一致。

四、Contigs的组装

与reads的拼接相比,contigs的组装的难度相对较小。这是因为contigs的长度较reads长很多,所含信息较多。故可以较为准确的组装成scaffold

(一)组装过程的难点[4]

Contigs组 装 过 程 中 的 难 点 主 要 有 二。一 是contigs中 含有大量的重复序列,不易确定contigs之间的相对顺序;二是由于contigs由reads拼接而成,其中不 免 会 有 一 些 错 误,这 些 错 误 也 会 对contigs的组装产生干扰。

(二)方法

Contigs组 装的方法较reads拼 接而言较多,一般常用的有图论法和光学图谱法(Optical mapping)两种。

1.图论法[5]

图论法是比较传统的方法,与reads拼接有相似的地方。它以contigs作为节点,由相连的读取对(Linking reads pair)作为边,由此形成算图。

其一般步骤为:库的构建:构建出含有所有reads的 库---计算相连读取对之 间的距离,并由此计算gap的长度---把长度放在边上,作为算图的数据。

其理想的输出结果是一条scaffold序列,对应一条染色体,包含以正确顺序排 列 的contigs和contigs之间gap的长度。

2.光学图谱法[6]

光学图谱法是一种较为新颖的方法。通过内切酶将DNA切断,此时DNA的片段的谱表现出一种特殊的指纹或是识别码的性质。利用光学方法追踪此信息得到相对位置,由此组装成正确的scaffold.

主要步骤为:将contigs放 置 在 光 学 图 谱上---修正光学图谱---做出contigs的连接图,由此决定最佳的contigs连接顺序。

光学图谱法的组装结果有着很高的覆盖率,巧妙运用光学图谱法可以获得很高的成本效益。

有研究表明,当与454平台获得的实验结果相结合的时候,光学图谱法可以迅速、价廉的得到排列好的定向的contigs组,由此可以产生一个将近完整的基因组。

(三)发展方向

Contigs组装过程的关键点 在于如何得到正确的连接顺序。现阶段此方面研究多集中在这一方向。

五、前景与展望

随着生物学研究向微观、向基因领域逐步延伸,高通量测序作为获得基因序列的主要方法,越来越受到重视,拼接技术也在不断发展。高通量测序的基因片段会变得海量且短小,应对此变化,拼接技术也会由确定“唯一的基因序列”向确定“最可能的基因序列”完成转变。因此,新一代的拼接技术会在准确率、覆盖率和速度上,作出超于现在拼接技术的改进。

参考文献:

[1]Anderson MW, Schrijver I. Next Generation DNASequencing and the Future of Genomic Medicine.?;1(1):38-69. doi:.

[2]Salzberg SL, Phillippy AM, Zimin A, et al. GAGE: Acritical evaluation of genome assemblies and Research. 2012;22 (3):557 -567. doi:.

[3]Deng X, Naccache SN, Ng T, et al. An ensemble strategythat significantly improves de novo assembly of microbialgenomes from metagenomic next -generation Acids Research. 2015;43 (7):e46. doi:.

[4]Latreille P, Norton S, Goldman BS, et al. Opticalmapping as a routine tool for bacterial genome Genomics. 2007;8:321. doi: -2164-8-321.

[5]Hunt M, Newbold C, Berriman M, Otto TD. Acomprehensive evaluation of assembly scaffolding Biology. 2014;15 (3):R42. doi: -2014 -15-3-r42.

[6]Nagarajan N, Read TD, Pop M. Scaffolding andvalidation of bacterial genome assemblies using opticalrestriction . 2008;24 (10):1229 .

物体检测看论文的顺序

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二、论文的摘要

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1、从事这一研究的目的和重要性

2、研究的主要内容

3、完成了哪些工作

4、获得的基本结论和研究成果,突出论文的新见解

5、结构或结果的意义

三、论文关键词

关键词属于主题词中的一类,主题词除关键词外,还包含有单元词、标题词和叙词。关键词是标识文献的主题内容,单未经规范处理的主题词。

四、引言

又称为前言,属于正片论文的引论部分。写作内容包括:

1、研究的理由

2、研究目的

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5、作用和意义

五、正文部分

论文的主题,占据论文大部分篇幅。论文所体现的创造性成果或新的研究结果,都将在这一部分得到充分的反映,要求这部分内容一定要充实,论据充分可靠,论证有利,主题明确。

六、参考文献

参考文献是文章在研究过程和论文撰写是所参考过的有关文献的目录,参考文献的完整标注是对原作者的尊重。不只在格式上有具体要求,在数量、种类、年份等方面又有相关要求。

多数学校会先进行论文答辩按照正常的论文审核顺序是你的论文先提交给自己的导师,导师通过审核之后你就可以等着答辩了。论文答辩查重并不是同时进行的,而是先答辩后进行查重。只有通过了答辩之后,你的论文才能够进入到学校的论文查重系统中,如果答辩没有通过论文是无法查重的。这只是多数学校的安排,所以我们还是要提前了解一下自己的学校是如何安排的才行,一般答辩之前学校都是会有相应通知的。部分学校先查重后答辩当然每一个学校的顺序都是不一样的,论文答辩查重也有可能会调整,也有很多学校事先进行论文查重。当导师确定了你的论文没有问题之后,就会要求你按照学校的标准来提交一个word文档,然后导师对你的论文进行查重。论文查重没有问题你才能进入到答辩环节,不过少数学校会这样做,多数学校还是会先进行答辩,这样比较容易操作,审核也会简单一些。顺序不同论文格式也不同因为论文答辩查重的顺序不同,论文的格式也会有很大的差异性。可能很多人都没有注意到这一点,因为你的论文如果事先查重,就要为了查重而牺牲很多语句,甚至是一些数据。导师一般也会宽松一些,知道大家都为了能降重会修改一些格式,不会特别较真。但是如果你的论文需要答辩,还是需要打印一式四份的,其他老师也要看你的论文。只是按照论文检测系统降重的标准来提交的,论文肯定就无法通过审核了,建议他家还是应该将论文分别保存成不同的类别,这样使用的时候直接打印就可以。

病媒生物监测毕业论文

病媒生物预防控制管理规定第一条 为了防止传染病的发生与流行,保障人民群众身体健康,根据《中华人民共和国传染病防治法》,制订本规定。第二条 本规定所称病媒生物是指能够将病原体从人或者其他动物传播给人的下列生物:(一)蚊;(二)蝇;(三)蟑螂;(四)鼠;(五)省级以上爱国卫生运动委员会(以下简称爱卫会)规定的其它病媒生物。第三条 县级以上爱卫会要将病媒生物预防控制纳入爱卫会工作规划,负责对病媒生物预防控制工作进行指导、监督。爱卫会各成员单位在各自职责范围内负责病媒生物的预防控制工作。第四条 全国爱卫会办公室负责全国病媒生物控制的统筹规划、综合协调和宏观管理工作。省、自治区、直辖市爱卫会负责本行政区域的病媒生物预防控制工作,并履行下列职责:(一)组织开展病媒生物预防控制宣传教育;(二)组织开展病媒生物预防控制活动;(三)组织开展病媒生物预防控制工作检查;(四)表彰奖励病媒生物预防控制先进单位和个人;(五)省级人民政府规定的其他职责。第五条 病媒生物预防控制工作遵循以环境治理为主的综合预防控制原则,坚持政府组织与全社会参与相结合、鼓励个人和家庭搞好居家卫生的方针。第六条 病媒生物预防控制工作实行单位责任制。机关、企业、事业单位和居民委员会、村民委员会等要建立日常的病媒生物预防控制制度,采取有效措施,控制病媒生物密度,清除病媒生物孳生地,防止病媒生物孳生、繁殖和扩散,避免和减少病媒生物危害的发生。第七条 省、自治区、直辖市爱卫会要根据本行政区域人口分布、病媒生物密度、传染病流行等情况确定病媒生物重点预防控制地区、场所,并提出具体的预防控制目标和要求。第八条 省、自治区、直辖市爱卫会可以根据当地病媒生物活动高峰规律,组织集中、统一的病媒生物预防控制活动。机关、企业、事业单位和居民委员会、村民委员会等要按照当地爱卫会的部署,积极参加病媒生物预防控制活动。第九条医院、宾馆、机场、港口、火车站、汽车站、交通工具等人员集中的场所和食品生产经营单位、建筑工地、农副产品市场、废品收购站、垃圾转运站、垃圾处理场、粮库等易招致或者孳生病媒生物的场所,要指定人员负责病媒生物的预防控制工作,并设置病媒生物防范和消杀设施。第十条 城镇建设规划要包括治理蚊蝇孳生地等病媒生物预防控制工作。建筑物管线、市政管井和下水道系统要设有防范病媒生物侵害的设施。第十一条 农村地区要结合改厕、环境改造、垃圾与粪便管理等工作,在清除孳生地的基础上,开展病媒生物预防控制工作。第十二条 病媒生物预防控制使用的药物、器械必须符合国家的相关规定,禁止使用违禁药品。第十三条 县级以上地方爱卫会要组织专业机构对病媒生物预防控制效果进行评估,对发现的问题要及时采取措施予以解决;有责任单位的,要及时责令整改。第十四条 县级以上疾病预防控制机构要开展病媒生物监测工作,并及时将监测结果报告当地爱卫会。疾病预防控制机构要协助爱卫会开展病媒生物预防控制的技术指导和专业培训工作。第十五条 鼓励病媒生物预防控制服务机构为单位和个人提供符合质量安全要求、收费合理的病媒生物预防控制服务。第十六条 对具备以下条件的病媒生物预防控制服务机构,省、自治区、直辖市爱卫会办公室可以建立公示制度,以方便需要服务的单位和个人选择:(一)有合法资质;(二)有完整的病媒生物预防控制操作规程;(三)有与业务量相适应的专业知识和技能培训合格的技术人员;(四)有符合要求的经营场所、库房、专用药物与器械;(五)收费合理。第十七条 各级爱卫会要将病媒生物预防控制所需经费纳入工作预算。第十八条 鼓励和支持开展病媒生物预防控制技术的研究,鼓励和支持推广应用先进的病媒生物预防控制技术、方法和药械。第十九条 各级爱卫会要对在病媒生物预防控制工作中做出突出贡献的单位和个人予以表彰和奖励。第二十条 本规定自2010年1月1日起施行。

做好春季灭鼠工作,开展灭鼠防疫等相关活动,对于提高大家健康意识,做好卫生工作,都具有非常重要的作用。难么,今天我就给大家整理了五篇优秀的春季灭鼠 总结 ,希望对大家的工作和学习有所帮助,欢迎阅读!

第一篇:春季灭鼠总结

一、采取的主要 措施

1、领导重视人员到位责任到位

**县农业局领导对农区统一灭鼠工作高度重视,多次召开灭鼠工作专题会议,强调要从农业生产安全、农民增收和群众身体健康的高度上加深认识,增强责任感;制定统一灭鼠 工作计划 ,做到领导、经费、人员、技术和物资落实到位,专门成立了“**县农区统一灭鼠工作领导小组”,由**县农业局分管副局长担任组长,植保站站长担任副组长,***副站长任办公室主任,成员由植保站、农技站、土肥站等相关单位的6位技术员组成。把责任和任务具体分解落实到位并实行人员责任制,把任务落实到人,实行分工不分家,定期总结,按时完成。全县*个乡镇也都成立了相应机构,落实人员负责,狠抓落实,齐抓共管,真正把农区灭鼠工作落实到位,保障农业生产安全,促进农民增收。

2、加强鼠情监测大力推广农区统一灭鼠技术

按照**省植保总站的要求,在今年的*、*、*、*月分别组织技术人员开展了鼠情系统监测调查,严格按系统监测的技术规范进行操作,准确掌握我省鼠害的分布和密度等实情第一手资料,深入分析研究各地鼠情动态,定期向主管部门和上级植保站汇报,及时发布预测预报,科学准确指导统一灭鼠工作。据统计,全年共开展系统监测*次,出动技术人员**人次。在加强监测工作的同时,抓住春、秋两个最佳灭鼠季节,在农村(田)鼠害重发区域大力推广毒饵站灭鼠技术,灵活运用鼠害综合治理技术,在试验、示范的基础上,结合当地生态环境、鼠害发生特点,大力推广使用的安全性强、灭鼠效果好、成本低廉的杀鼠剂产品和灭鼠 方法 ,有效的控制农田鼠害,促进灭鼠工作的有效持续开展。据统计,全区共出动灭鼠人员**人次,组织统一灭鼠面积达**万亩,配制和投放毒饵**公斤,投入各种灭鼠器械**万件。

3、加大宣传和培训提高灭鼠技术

主要采取了举办培训班、出墙报,结合农业科技下乡活动,通过广播、报刊、和印发灭鼠宣传资料等多种形式,广泛宣传灭鼠、防病、保粮、保健康的重要意义及科学灭鼠技术知识。印发资料主要有:《农村灭鼠技术问题》、《农村灭鼠技术挂图》、《**省鼠害防治》等,促进灭鼠技术进村入户,广泛宣传发动群众参加灭鼠活动。统一灭鼠以常年鼠害发生区为重点区域,农舍推行统一毒饵诱杀,农田实施分区分类控制。特别是大力宣传了鼠药的科学使用,毒饵站新技术的推广,保护生态环境和综合灭鼠技术。在全年的灭鼠工作中,以**镇、**乡为示范样板点,带动了全区灭鼠工作的开展。全省**个乡镇分别设立鼠药供应点,满足群众灭鼠对鼠药的要求,促进了全区灭工作的有效开展。据统计,共建立区级鼠药供应点*个,乡(镇)级鼠药供应点*个,举办各类培训班**场次,印发宣传资料***份,广播宣传**次,培训、宣传群众达***人次。

4、加强管理搞好服务

农业主管部门加大对杀鼠剂市场执法力度,积极整顿,切实加强鼠药市场的管理、监控和安全使用,从源头上防止国家禁用的剧毒杀鼠剂流入市场,防止生产性中毒事故发生。植保站重点理顺鼠药经营 渠道 ,以更加完善的定点经营网络,保障高效安全杀鼠剂的供应,方便群众自发灭鼠,确保灭鼠工作抓出成效。

5、增加投入抓好农区统一灭鼠示范样板

今年我省农区统一灭鼠工作得到地方财政和省植保总站在经费上的大力支持和本地农民的密切配合,促进示范样板建设顺利进行。在**乡***村建成一个***亩的农区统一灭鼠示范样板,其中水田面积为***亩,旱地面积为***亩;其他各乡镇分别建立示范区****亩,示范户***户。示范区内大力推广灭鼠关键配套技术,使用高效安全杀鼠剂(杀鼠迷水剂、80敌鼠钠盐原粉),扩大生态、生物控鼠技术试验示范,进一步探索开展新型安全杀鼠药剂及其他有效灭鼠技术试验,全面提高农区鼠害防治效果

。据统计,**县农业局共投入资金**万元用于购买药剂和灭鼠器具及宣传等费用,农民自筹资金**万元;其中**乡**村统一灭鼠示范区春、秋两季共配制毒饵**(稻谷)公斤,使用毒饵站**多只,涉及该村**个自然屯,农户**户共***人口。

二、鼠害发生特点

20XX年在我地各乡(镇)灭鼠示范定点监测和大田普查结果显示,农田鼠

害整体为中等偏轻局部偏重程度发生。其发生种类以黄胸鼠、褐家鼠、小家鼠为主要分布,主要分布于农田、及家舍。鼠害种群相对稳定,而发生数量呈上升趋势。构成这一问题的因素是多方面的,第一,随着农业生产结构调整,经济作物 种植 面积扩大,粮田复种作物指数提高,一年四季害鼠食源比较丰富;第二,近几年天气较干旱,不少水利设施年久失修,水浇地的减少以及各种化学农药的大面积使用致使天敌数量的减少等,都为农田鼠害发生繁殖创造了有利条件。

三、鼠情普查监测

通过20XX年在我区的**镇、**乡、**镇和**乡进行定点监测,基本上总结出了我地农田害鼠的种类、种落及主要优势种的年内数量变动规律。调查方法:在以上四个乡(镇)中分别选择不同类型(水田、旱地、及农舍)且具有代表性的样点地3块(每块样地15亩)进行监测,然后,采用统一铁板鼠夹,以豆腐制品为诱饵,采用5×10m的规格布夹。农舍监测以每样点100户为标准布夹。结果统计样地内害鼠的发生种类,数量,密度,推算出当地害鼠发生种类,数量,密度,为害损失等。今年害鼠监测,共涉及到4个乡(镇),6个村(屯)18个样地,代表农户每乡(镇)**户共***户,共投放灭鼠夹***夹次。

四、存在问题

1、防治经费不足,影响部分乡(镇)灭鼠工作真正落实到位。由于经费有限,技术宣传和培训覆盖面小,影响技术到位率;举办示范样板难度大,影响统一灭鼠工作真正落实到位。

2、统一灭鼠技术人员的专业素质还需提高,防治手段落后,配备和应用现代化科技设备及信息化程度低,制约着农区统一灭鼠工作向深度发展。

五、20XX年工作计划

1、加强领导,确保“五到位”。主动向有关领导汇报,积极争取党委、政府及上级主管部门的重视和支持,确保“领导、经费、人员、技术、物资”五到位,为明年春秋季农区灭鼠示范、组织发动、宣传培训及技术服务工作打下坚实的基础,以便广泛的发动群众灭鼠,保障农业生产安全。

2、加强鼠情监测,科学指导灭鼠。坚持开展鼠情系统监测调查,掌握田间第一手资料,分析鼠情动态,定期向主管部门和上级业务部门汇报,及时发布预测预报,科学准确指导统一灭鼠工作。

3、是要不断的技术创新。在传统的有效的综合灭鼠技术的基础上,大力推广应用毒饵站技术,积极引进现代灭鼠新技术,以适应新时期对灭鼠技术的要求。

第二篇:春季灭鼠总结

除"四害"工作是爱国卫生工作的一项重要内容,也是巩固国家卫生县城创建的重要工作。我办根据《**市卫生局关于开展2014年秋季统一灭鼠活动的通知》(渝爱卫〔2014〕13号)文件精神的要求,结合我县巩固国家卫生县城工作的总体目标,以第二十五个爱国卫生活动月为契机,积极组织安排了以灭鼠活动为重点的爱国卫生工作,按要求开展了秋季灭鼠投药消杀活动,取得了预期的效果,现将具体活动情况总结如下:

一、明确工作目标,制定工作方案,确保此项工作取得阶段性成果

为了统一开展好此次灭鼠活动,县爱卫办首先成立了灭鼠领导小组,下发《**县2014年秋季统一灭鼠方案》,各乡镇、街道办事处根据本辖区的"四害"情况制定了消杀工作实施计划;并利用"爱卫月"活动召开动员会议,协调、组织、监督、指导此项工作。

二、有序开展了"病媒生物"防治工作

我县落实了病媒生物防制监控制度,各承担责任的部门积极开展了病媒生物监测工作,监测范围全面,监测方法规范,数据真实可靠,基本能准确反映病媒生物危害的现状,为我县病媒生物防制工作提供了科学准确的依据。同时,我县的除"四害"前置制度,有效的促进了病媒生物防治工作再上新台阶。

三、结合第二十五个"爱卫月"活动,集中清理整治了环境卫生

今年是我县巩固国家卫生县城创建目标的关键年,为落实好"创卫"指挥部的工作要求,爱卫办作为"创卫"牵头单位,主抓除"四害"工作。以第二十五个"爱卫月"活动为契机,积极行动,深入持久地开展了我县的爱国卫生工作,改善了环境卫生面貌,提高了人民群众的卫生健康水平。各乡镇、街道办事处在辖区单位、社区居委会广泛开展灭鼠宣传活动,做到家喻户晓。

四、开展集中灭鼠、灭蟑活动

在做好秋季灭鼠工作的基础上,对原有鼠存在的单位进行重点检查,同时用毒饵巩固杀灭成果,防止其孳生蔓延;对新发现鼠的单位,全面消杀,发现一处杀一处,做好灭鼠药物的投放工作,投放毒饵做到"四不漏",即不漏片,不漏单位(户),不漏房间,不漏部位,切实保证灭鼠效果。据统计,此次春季灭鼠活动共投入专项经费10万元;投放药品:溴敌隆毒饵3000公斤,安装毒饵盒255个,设置防鼠设施150处。

五、投药后灭效情况

县爱卫办于20XX年9月22日-10月30日,对城区春季"爱卫月"活动实施效果进行了检查。通过检查病媒生物防治工作落实情况,看到绝大部分的单位、社区、特殊行业均能按文件要求认真落实春季病媒生物防治各项工作任务,早安排,早部署,精心策划,周密安排活动内容,取得了令人满意的效果。如:两江假日酒店、三峡风大酒店、县人民医院、县中医院、四大家机关、车站等单位在病媒生物防治工作中防治并举,取得了很好的效果。但居民区、部分单位和特殊行业病媒生物杀灭药品不足,达不到完全覆盖率,希望各相关部门领导高度重视,加大资金投入,严格控制四害密度,为巩固国家卫生县城创建工作打下良好基础。

六、完善了组织制度及档案资料

建立了县、街道办事处(乡镇)、居委会(村)三级"四害"监测网络和"四害"信息举报处理制度。认真办理群众卫生投诉,详细记载群众提供的"四害"信息、相应解决办法、投放药物等内容。

总之,县爱卫办把春季灭鼠工作作为当前爱国卫生工作中的一项重要任务一抓到底,抓出成效,做到药物购置到位、投放到位、技术措施到位,力争使行业卫生面貌在短期内明显改观,切实把灭鼠工作各项措施落到实处,确保灭鼠工作的顺利进行,为实现我市创建国家卫生城市的目标创造良好的环境。

第三篇:春季灭鼠总结

夏季是病媒生物繁殖高峰期及传播疾病的高发期,也是开展病媒生物防治工作的有利时机,接到县爱卫办有关夏季灭鼠工作的通知后,我镇针对夏季灭鼠活动进行了动员和部署,明确了责任,落实了任务。全镇认真按照爱卫办的要求,认真贯彻落实今夏突击灭鼠工作任务,抓重点,注重实效,实行防灭结合、药械并举的科学防治原理,进一步降低鼠害密度,有效地防止流行性传染病的发生,改善人民群众的生产、生活环境,保障人民群众身体健康,更好地为我镇经济建设服务,现将情况汇报如下:

一、加强领导,广泛宣传

今年夏季灭鼠活动,得到了镇领导高度重视,成立了灭鼠领导小组,做到主要领导亲自抓、负总责,分管领导具体抓、抓落实,把各项工作落到实处。在统一思想、统一认识的基础上实现了统一时间、统一用药、统一灭鼠,灭鼠效果达到了不留空白区、不留灭鼠死角。

同时灭鼠工作又是一项长期的社会工程,面广量大,涉及千家万户、各行各业,必须依靠专业队伍与群众运动相结合,动员人人参与,打“全民战争”,才能真正取得实效。今

年以来,由镇爱卫办牵头,召开了灭鼠工作会议,下达任务,明确要求,落实措施。各行政村十分重视,利用多种宣传形式向群众进行宣传,把鼠的危害性、灭鼠的重要性和灭鼠的方法告知广大群众,营造了良好的灭鼠氛围,大大提高了广大群众对灭鼠重要性的认识和工作的积极性,有力地推动了全社会参与的良好局面。

二、推进社会大环境整治,清除鼠害孳生源

在开展突击灭鼠活动中,我镇集中时间,集中精力,集中财力,确保整治到位。对重点单位设置防鼠网、修补门窗、设置纱门、纱窗等防鼠设施。对农村,我们重点抓了清除露天粪坑,清理宅前屋后乱堆放和暴露垃圾,有效地清除鼠害孳生场所。力求清除死角,消灭鼠栖息繁殖场所、添堵鼠洞、清除鼠迹,从而有效改善环境,控制鼠类生存环境,真正使灭鼠工作做到宣传与整治相结合。

三、强化科学防治,实行药械并举

在环境整治的基础上,我们开展科学消杀,灭鼠药物由镇里统一发放、有效地制止了国家明令禁止的除害药物和未经审批的不合格产品。今年针对镇里的实际情况,增加除害经费投入和药械的数量,各行政村增设了一定数量的毒饵

箱,进一步扩大了鼠药投放面增强了整体灭鼠工作的力度,有效地降低了鼠密度的回升。

四、存在问题

由于工作到位,上下协作,方法科学,今夏灭鼠工作取得了一定的成效,总体上达到了预期效果,但也存在一些问题需要引起注意。个别行政村对灭鼠工作重视不够,存在麻痹和侥幸心理。这些问题我们将进一步克服,在灭鼠工作上积累更多 经验 。我们还将继续持之以恒,坚持不懈,同心协力地抓好灭鼠工作,预防及病,开展好爱国卫生运动,营造一个良好的工作、生活环境。

第四篇:春季灭鼠总结

根据西教体函发(20XX)22号文件精神的通知,为进一步加强病媒生物防治,有效控制病媒生物疾病的传宝,切实保护好师生的健康,我校积极组织相关人员开展本次活动,对做的具体做的 工作总结 如下:

一、统一思想,提高认识,加强领导。

最近正是各种细菌滋生和流行病的多发季节,也是鼠类繁殖高峰期,更是开展爱国卫生的紧迫时期得关键时期。我校抓住这一契机,按照教体局同一时间安排和要求,将灭鼠工作列入重要议事日程。高度重视这次灭鼠工作,认真组织灭鼠工作,把灭鼠工作作为当前开展爱国卫生运动重要内容来抓。

二、加强宣传,全面发动,确保安全。

首先是宣传到位。结合学校实际,利用橱窗、板报等固定的宣传阵地,组织学生出 黑板报 ,达到良好的宣传效果,

提高了师生灭杀老鼠的意识。通过各种形式的宣传,进一步提高广大师生对开展爱国卫生活动和灭鼠行动重要性的认识,从而不断增强广大师生的健康意识,卫生意识,提高自我保健能力。

其次是措施到位。这次爱国卫生活动和灭鼠行动由校领导统一领导和组织实施,结合学校实际,制定了工作重点范围。主要借助后勤组的力量,后勤派专人对下水道、房角等老鼠孳生地进行了检查,分析原因,任务落实到人,对下水道、房角、水渠边进行了清理并喷洒药水。有针对性地对食堂等老鼠诱发地进行了连续投药7天,对残留的药物和鼠尸进行了深埋,并认真做好记录,随时检查灭杀效果。由于学校一直以来非常重视防鼠工作,所以校园内无一只老鼠出现。

我们将一如既往地做好灭鼠活动的宣传和实施,自觉搞好环境卫生,为师生创造和谐的生活和工作环境。

第五篇:春季灭鼠总结

为了保障全体职工身体健康,消灭鼠害,有效控制病媒生物孳生繁殖,预防传染病的发生和流行,我单位上下广泛宣传,深入发动,全民行动,共同参与,在我校范围内开展灭鼠活动,取得了初步成效。据统计,我校灭鼠活动投放灭鼠毒饵公斤,投放毒饵盒10个,夹鼠板1个,现将我校20XX年开展春季灭鼠工作总结如下:

一、加强了组织领导。把灭鼠工作作为改善环境,提高师生生活质量的重要内容,加强组织领导,成立了以张金喜为组长的病媒生物防制领导小组,安排专人具体实施灭鼠工作,药具使用 教育 局统一配发的合格产品,鼠药投放点设有警示标志,防止了人、畜我如中毒事件的发生。做到统一领导,统一行动,扎实有效地抓好灭鼠工作。

二、加强宣传,广泛发动。灭鼠工作是群众性、科学性很强的工作,我单位把灭鼠宣传工作纳入健康教育的重要内容,充分利用会议、发放资料、办专栏和广播等形式大力开展灭鼠防病宣传教育,宣传 安全知识 ,要求师生注意饮食卫生,提高他们自我保护能力和人人参与灭鼠活动的自觉性、积极性。并加强了我校的卫生综合治理,发动师生搞好环境卫生,彻底消除了四害赖以生存的栖息场所。

三、灭鼠活动的具体安排。一是准备阶段(3月10日--3月12日),宣传动员全校师生搞好环境卫生;二是集中灭杀阶段(3月13日—3月25日),在有鼠部位连续投药,进行定时检查,及时进行补投;三是集中清理整治,发现问题,及时处理问题,完善灭鼠设施、集中收集处理鼠尸,清除残存毒饵,进行焚烧深埋,做到不乱扔,预防传染病发生。

生物生物毕业论文

分子生物技术在微生物降解环境 污染物中的应用 [摘要〕介绍了与环境微生物关键降解酶基因的筛选、克隆及应用相关的分r生物技术,包括聚合酶链式反应技 术、基因重组技术、荧光原位杂交技术和生物信息学等技术,并对这些技术在污染物降解基因检测、筛选和克隆方 面的应用进行了阐述与探讨、 [关键词]分子生物技术;微生物;基因;环境污染物;降解 随着现代j:\地技术的发展,多环芳烃、含氯有 机物和硝基苯类化合物等人工合成井难以降解的 污染物大量排放,造成世界范围内的环境污染和生 态破坏,严重地威胁人类和其他生物的正常生存和 发展。利用微生物修复技术对受污染的水体及土 壤进行处理,凸显了其重要的意义和可行性。研究 人员发现并筛选到一些微生物,它们不仅对环境有 较高的适应性、对污染物有较高的耐受性,而且对 污染物有较强的降解效率和专一性。然而环境中 存在的大量微生物中仅有少于1%可通过传统的培 养方法进行培养、分离和纯化,绝大多数细菌需要 非常严格的营养条件川。因此,为了对修复环境有 所贡献却难以培养的微生物进行更全面了解,也为 了筛选到更多有利于降解环境污染物的微生物菌 种及其关键酶基因,分子生物技术和手段逐渐被广 泛应用到环境可降解污染物及降解机理方面的研 究中。 本文对近年来发展起来的聚合酶链式反应 (PCR)技术、基因重组技术、荧光原位杂交(FISH) 技术和生物信息学等多种分子生物技术进行了介 绍,并总结了它们在污染物降解基因检测、筛选和 克隆方面的应用。 1与环境污染物降解相关的分子生 物技术 及其相关技术 PCR是一种利用脱氧核糖核酸(DNA)半保留 复制原理,在体外扩增位于两段已知序列之间的 DNA区段从而得到大量拷贝的分子生物技术。根 据其模板、引物来源或扩增条件的不同,PcR技术 可分为以下几种:(l)反转录pCR(RT一PeR)技 术,将mRNA反转录为cDNA后再对其进行PCR 扩增,可用来构建cDNA文库,分析不同生长时期 的mRNA表达状况和相关性以及mRNA的定量测 定等;(2)巢式PCR技术,在扩增大片段目的DNA 时,先用非特意性引物扩增再用特意性引物对第一 次扩增产物进行第二次扩增,以获得可供分析的 DNA;(3)竞争PCR技术,是一种定量PCR,向PCR 反应体系中加人人工构建的带有突变的竞争模板, 通过控制竞争模板的浓度来确定目的模板的浓度, 对目的模板作定量研究;(4)实时荧光定量PCR技 术,在PCR反应体系中加人荧光基团,利用荧光信 号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线 对未知模板进行定量分析,该法已广泛用于基因表 达研究、转基因研究等方面;(5)扩增的rDNA限制 酶切分析技术,根据原核生物rDNA序列的保守性, 将扩增的rDNA片段进行酶切,通过酶切图谱来分 析菌间的多样性;(6)RNA随机引导PCR技术,基 于任意寡核昔酸引物与RNA之间可能的配对,在 低严谨度条件下经聚合酶催化使链延伸,将细胞总 RNA或InRNA作为反转录反应的模板,此技术结 合单链构象多态性,用非变性胶分辨大小相同而构 象不同的片段,可用于诊断遗传突变及分析污染条 件下序列的多态性;(7)随机扩增多态DNA (RAPD)技术,是一种基于PCR检测PCR引物结合 位点序列改变的方法,通常以10bp的寡核昔酸序 列为引物,对基因组DNA随机扩增,电泳分离染色 扩‘增产物,再分析多态性。 技术 FISH技术利用荧光标记的探针在细胞内与特 异的互补核酸序列杂交,通过激发杂交探针的荧光 来检测信号。荧光探针比放射性探针更安全,具有 较好的分辨力,不需要额外的检测步骤。近年来, 由于FISH技术具有灵敏、便捷等优点,迅速发展完 善成为研究环境微生物的有力工具。此外,可用不 同激发和散射波长的荧光染料标记探针,在一步反 应中同时检测几个靶序列。该技术主要包括试样 固定、预处理、预杂交、探针和试样变性、杂交、漂洗 去除未结合的探针、检测杂交信号等步骤。由于 165rRNA具有遗传稳定性,因此成为FISH技术检 测最常用的靶序列。 基因重组技术 基因重组技术是从供体生物的基因组中通过 酶切扩增等手段获取目的基因,与载体连接形成重 组DNA分子,再导入到受体细胞中,让外源基因得 以表达。在已经分离出的许多菌株中,与降解能力 有关的基因多在质粒体上。由于质粒很容易在细 菌的繁殖过程中遗失,对细菌降解能力的长期稳定 非常不利,可将其与污染物降解有关的酶基因重组 到大肠杆菌等微生物中进行表达,以此构建的各种 生物降解特性增强的重组菌可用于污染环境的治 理修复或发酵某些废弃物。 生物信息学 20世纪后期,生物学的迅猛发展,从数量上和 质量上极大地丰富了基因组数据库、蛋白质数据 库、酶数据库和文献数据库等许多生物科学的数据 资源。已有多个国家和国际科研组织建立了生物 信息数据库,如欧洲分子生物学实验室(Eur叩ean MolecularBiologyLaboratory)核酸序列数据库和美 国国家生物技术情报中心(Nationaleente:fo:Bio- technologyInformation,NCBI)基因序列数据库等。 科学家利用计算机及生物信息分析软件分析这些 数据资源,确定大分子序列、结构、表达模式和生化 途径与生物数据之间的关系,区分生物个体间遗传 差异,揭示DNA多样性。例如,基本局部比对搜索 工具(BasieLoealAlignmentSearehTool,BLAST), 是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似 性比较的分析工具。它基于Altschul等的方法「2〕, 在序列数据库中对查询序列进行同源性比对工作。 BLAST程序可对一条或多条、任何数量、任何形式的 序列在一个或多个核酸或蛋白序列库中进行比对,甚 至将有缺口的比对序列也考虑在内,利用比较结果中 的得分对序列进行相似性说明。基因的序列分析可 揭示出生物物种之间的关系,在污染治理研究中可用 于生物基因组特殊区域或特异基因的测序。 2分子生物技术在环境污染物降解 中的应用 土壤试样总DNA的提取 用适当方法直接从土壤中提取DNA并纯化, 是从分子生物学角度对土壤微生物进行研究的前 提条件,而后可进行酶切、PCR扩增、核酸分子杂交 等分子生物学技术操作。从土壤中提取微生物 DNA主要分为汽接法和间接法}’{。直接法是在 ogram等的方法基础卜发展起来的,其主要包括2 个步骤:(l)原位细胞裂解;(2)DNA提取和纯化。 直接法提取的DNA超过细菌总DNA的60%且省 力,但提取的DNA常常有折断、腐殖酸污染、甚至 提取物中还夹杂有未知的胞外DNA和真核生物的 DNA。最先报道间接法的是Faegri等[‘〕,其主要包 括4个步骤:(l)分散土壤;(2)分离细胞与土壤; (3)细胞裂解;(4)DNA纯化。间接法提取DNA 产量低且费力,但纯度较高、DNA损伤小,提取的 大片段DNA可用来构建cos而d和细菌人工染色体 文库等。 采用PCR及相关技术扩增分析DNA片段 可降解污染物的微生物必然能产生分解代谢 该污染物的酶。selvaratnam等L’l用编码苯酚单加 氧酶dmpN摹因的RT一PCR技术来检测序列间歇 式活性污泥反应器‘{一,降解酚的假单胞菌。检测结 果表明,RT一PCR技术不仅能检测微生物降解酚的 能力,还能测量dmpN基因的转录水平,从而确定假 单胞菌特殊的分解活性,发现了在转录水平下,酚 浓度与通气时间之问存在正相关关系。 将PCR技术和变性梯度凝胶电泳(DGGE)结 合起来,在变性条件适当的情况下能分辨一个碱基 对,分辨率较高。染色后的凝胶用成像系统进行分 析,可在一定程度l几反应试样的复杂性。条带的多 少能反应试样「 一 }1微生物组成的差异,条带的亮度能 反应试样中微生物的多少。基于以上优点,日前该 技术在微生物群落结构的分析和动态研究方面得 到了厂‘泛应用。DGGE可通过分析PCR扩增的基 因点突变来探索微生物的复杂性。徐玉泉等[“〕从 某废水中分离出一株能以苯酚为惟一碳源的菌株 PHEA一2,使用PCR一DGGE技术对该菌165 rDNA进行分析,发现该菌与醋酸钙不动杆菌同源。 M盯sh等r了)利用PcR一DGGE技术获得了活性污泥 中真核微生物的种群变化情况。王峰等下8〕采用 PCR一DGGE技术对城市污水化学生物絮凝处理中 活性污泥和生物膜微生物种群结构进行了分析,结 果表明活性污泥培养前后微生物种群结构发生r 很大改变。 RAPD技术也是一种应用比较广泛的以多态性 引物来扩增某些片段的技术。RAPD技术可用于检 测含有混合微生物种群的各种微生物反应器中微 生物的多样性。用RAPD技术分析检测实验室规 模的油脂淤泥培养料中的细菌菌群发现,用油脂淤 泥改良过的培养料比未改良的更适于不同的微生 物种群生长[9j。vainio等t’。〕从516种孤立的菌落 中提取出165rDNA,经PCR扩增后进行测序,检测 活性污泥中微生物种群的结构。这些组合技术的 应用显著增强r对微生物的检测和鉴定能力,为理 论研究工艺优化及提高生物处理效率提供了条件。 基因重组 基因工程技术应用于环境保护起始于20世纪 80年代。其基本原理是通过基因分离和重组技术, 将目的基因片段,比如可编码降解某种污染物的 酶,转移到受体生物细胞中并表达,使受体生物具 有该目的基因表达显现的特殊性状,从而达到治理 污染的目的。找到特定污染的抗性基因,利用基因 重组技术转基因后也可获得其他抗性植株以及筛 选到可转化污染物的植物,还可开发超量积累植物 进行污染土壤的生物修复。 罗如新等L”〕用放射性同位素标记tfdc基因片 段作探针,Southemblot杂交定位Ll菌株的邻苯二 酚1,2一双加氧酶基因位于Pstl的I片段和BamH I的M、N片段,回收并将其直接克隆至表达载体 pKT230卜,获得的重组子能转化不具开环酶活性 的甲胺磷降解菌P2,得到高于天然宿主21倍的邻 苯二酚1,2一双加氧酶。stingley等{”〕通过构建基 因文库和重组质粒等基因工程方法证实了NidAB 双加氧酶是降解菲的关键酶类,并首次鉴定出此基 因通过磷苯二甲酸实现降解功能。chae等‘”}发现 不能降解苯酚的su如lobusso扣taricu、98/2菌株中 的儿茶酚2,3一双加氧酶基因与能降解苯酚的 sulfolo右u,,o如taricu、咫有[6J源区,分析得知它们 是山共同祖先进化而来。把儿茶酚2,3一双加氧酶 基因克隆到大肠杆菌中表达,可获得有较高降解活 性的双加氧酶。 重金属污染是环境污染的重要方面之一。随 着分子生物学技术的发展,越来越多的修复性蛋白 基因正被从植物、微生物和动物中陆续分离出来, 如汞离子还原酶基因、有机汞裂解酶基因、汞转运 蛋自基因、金属硫蛋白基因、植物络合素合成酶基 因、铁离子还原酶基因和锌转运蛋白基因L’‘〕。这些 基因通过基因工程的改造,重组到合适的受休细胞 中表达相应的蛋白质和酶,达到治理难以降解的有 毒有害污染物的目的。sorsa等〔”〕把MTS插人 LamB序列的153位点,在中表达MTs,解决 r细胞内MTs对金属离子有限的吸附能力。综L 所述,基因重组技术具有快速、高效的特性,已逐渐 成为环境生物技术的研究热点。 技术 FISH技术利用核糖体内长度适中(约1500bp)、 高度保守的165:RNA序列作为理想的基因分类靶 序列,其中使用的165:RNA寡核普酸探针一般是 进行了荧光标记的20bp左右特异性核昔酸片段, 利用该报告分子(如生物素、地高辛)与荧光素标记 的特异亲和素之间的免疫化学反应,经荧光检测系 统对待测DNA进行定性、定量或相对定位分析。 FISH技术能提供处理过程中微生物的数量、空间分 布和原位生理学等信息。 硝化细菌是一类生理上非常特殊的化能自氧 菌,传统的研究方法要经过富集、分离、分类和鉴定 步骤,耗时长。HSH技术的引人解决了上述困难。 FlsH技术还被广泛用于活性污泥系统、硝化流化床 反应器和膜生物反应器等废水处理系统}’61。 基因工程微生物越来越多地被用于农业害虫 控制和环境污染的生物修复,对人类健康和环境的 影响引起广泛关注。1994年出现了一种新的标记 系统:绿色荧光蛋白(GFP),由于GFP基因表达产 物对细胞没有毒害作用,且由GFP产生的荧光标记 检测卜分方便、简单。在某些被污染的环境中可分 离出降解该污染物的细菌,通过基因重组等手段使 用GFP分子标记,可更容易的分离检测被标记的 细胞叫。 Bastes等[’8]进行了苯酚降解菌染色体GFP基 因标记实验。通过PCR和Southemblot分析,证明 GFP基因已成功整合到宿主细胞的染色体中。对 标记菌与野生型的降解能力比较结果证明,GFP分 子标记的插人并不影响细胞的苯酚降解能力。 用G即标记Pseudomonasputida,研究活性淤 泥中细菌存活情况{’9飞。Pseudomonasputida被转到 活性淤泥2min后,观察到细胞在淤泥絮凝物间自 由游动;培养3d后,发现荧光细胞减少,大部分已 被合并到淤泥絮凝物中,以防止细菌被原生动物捕 食。用oFP标记石.eozi和Serraliamarceseern,考 察菌株附到絮凝物卜的过程{’()j。使用表面荧光显 微镜能将带有GFP标记的细胞从活性污泥中区分 开,井进行观察和记数。而聚焦激光扫描显微镜 (cLsM)可使GFP标记细菌产生三维轮廓,结合表 面荧光显微镜和CLSM观察GFP标记细胞,结果表 明,细胞表面疏水性在细菌附到絮凝物的过程中起 重要作用,两种细菌附在絮凝物上的模式有很大不 同,通过这种方法可更好地理解细菌赫附机理,有 助于提高废水处理效果。 3结语 分子生物技术的应用使研究人员可从微观的 角度更细致深人地了解微生物对污染物降解的具 体生理生化机制,在分子水平 _ _ [揭示生物体吸收、 迁移、积累有害物质最终被毒害,及适应、抗性等生 态问题,从而筛选到更多有利用价值的微生物。随 着越来越多微生物全部基因序列的解码,对各种细 菌体内可降解基因的分布和表达会有更深人的了 解,有关技术的发展和成熟必将对污染物的降解过 程有一个整体的、生态水平上的认识。 参考文献 l李凤,刘世贵 . 分子生物学技术在环境微生物研究中的 应用 . 世界科技研究与发展,2003,25(4):88一92 2AltsehulSF,GishW,MillerW, mentsearehtool . JMolBiol,1990,215(3):403一410 3魏志琴,曾秀敏,宋培勇 . 土壤微生物DNA提取方法研 究进展 . 遵义师范学院学报,2006,8(4):53一56 4FaegriA,TorsvikVL,]andfunga] aetivitiesin5011:seParationofbacteriaandfungibyaraPid fraetionatedeentrifugationteehnique5011BiolBioehem, 1977,9(2):105一112 5SelvaratnamS,SehoedelBA,MeFarlandBL,etal APPlieationofreversetranseriPtasePCRformonitoring exPressionoftheeataboliedmPNgeneinaPhenol- degradingsequencingbatehreaetor . APPIEnviron Microbiol,1995,61(11):3981一3985 6徐玉泉,张维,陈明等 . 一株苯酚降解菌的分离和鉴 定 . 环境科学学报,2000,20(4):450一455 7MarshTL,LiuWT,ForneyLJ . Beginningamoleeular analysisoftheeukiU洲aleollllllunityinaetivatedsludge. WaterSeiTechnol,1998,37(4一5):455一460 8王峰,傅以钢,夏四清等.PCR一DGGE技术在城市污 水化学生物絮凝处理中的特点 . 环境科学,2004,25 (6):74一79 9涂书新,韦朝阳 . 我国生物修复技术的现状与展望 . 地 理科学进展,2004,23(6):20一31 10VainioEJ,MoilanenA,KoivulaTT,etal . ComParison ofpartial165rRNAgenesequeneesobtainedfromactiva- tedsludgebaeteria . APPIMierobiolBioteehnol,1997,48 (l):73一79 11罗如新,张素琴,李顺鹏 . 邻苯二酚1,2一双加氧酶

生物方向太多了,题目都是不一样的,我们做毒理的论文简单点的就是做几种药物急毒性,或者慢性毒性。

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