生物学的毕业论文开题报告

随着计算技术和生物技术的进步,当前生物医学文献正在以前所 未有的速度增长。这些文献中蕴含着最新的研究进展和丰富的生物医学知识,对于生物医学研究者具有重要意义。然而数以千万计的文献使得研究者追踪和整理自己 需要的知识和信息变得越来越困难。文本挖掘技术可以解决这一问题,帮助生物医学研究者提高从文献中获取知识和信息的效率。因此针对生物医学文献的文本挖掘 研究具有重要的应用价值。判别式模型是一类直接利用特征来预测目标变量的发生概率的机器学习模型,本文中主要用到的判别式模型有最大熵模型和条件随机域模 型。相对于产生式模型,判别式模型降低了特征之间的独立性假设的要求,并且与很多文本挖掘任务的需求相一致,因而更有可能取得好的效果。本文主要研究如何 利用判别式模型来解决生物医学文献挖掘中的问题。具体地,我们研究了生物医学文本挖掘中的三个任务:生物医学名实体识别、生物医学实体规范化以及生物医学 语义关系抽取。在这3任务中,第二个任务是第一个任务在语义处理上的延伸,前两个任务是第三个任务的基础。本文的主要内容包含以下4个方面。生物医学名实 体识别的目标是确定一个给定的文本集合内的某一类型的实体的名字的所有实例,它是进行深层次文本挖掘的必要步骤之一。本文在考察了生物医学领域实体识别的 特点和难点,分析了目前已有的生物医学实体识别方法的优缺点的基础上,提出了利用条件随机域模型结合丰富特征集来进行生物医学实体识别的方法。这些特征包 括:构词法特征、上下文特征和句法特征。其中,浅层句法特征是首次被引入到条件随机域模型中,同时用来进行实体的边界检测和类别判断。实验表明,这一特征 可以有效地提高名实体识别的效果。有监督的机器学习方法需要大规模的标注语料。大量的电子文献使得在生物医学领域获取未标记的语料已相当容易,但是对语料 进行标注仍然是一件昂贵的工作。针对在生物医学名实体识别中有监督学习所需的大规模训练语料比较难以获取的问题,本文提出了基于最大熵模型的协同训练的半 监督学习方法。该方法可以利用大量的未标注语料来提高在较少的标注语料的基础上学习到的分类器的名实体识别性能。为了进一步提高半监督学习的效果,本文将 主动学习引入到半监督学习的过程中。实验表明,基于最大熵模型的协同训练方法可以有效地提高初始分类器的识别性能。灵活的生物医学实体命名方式使得生物医 学实体具有严重的歧义。这已成为对生物医学文献进行深层自动文本挖掘的主要障碍之一。生物医学实体规范化的提出就是为了解决这一问题。生物医学实体规范化 就是把生物医学文献中表达同一概念的不同变体映射到统一的概念标识符。本文提出了一种用于生物医学实体规范化的多层歧义消解框架。实体规范化过程中不同阶 段有不同的歧义情形,在本文提出的框架中,针对这些情形采用了有针对性的解决策略,包括:基于词典的实体名字检测,基于机器学习方法的候选选择以及基于知 识的歧义消解。在BioCreAtIvE2006基因名字规范化任务的测试集上的实验表明本文提出的框架可以有效地解决规范化过程中的各种歧义。生物医学 语义关系抽取是生物医学文本挖掘的主要研究内容之一,是从无结构的生物医学文献中抽取出生物医学知识的重要手段。在实际应用中,生物医学语义关系的定义有 宽泛和具体之分。本文将宽泛定义和具体定义的生物医学语义关系抽取分别看作二分类和多分类问题,提出基于最大熵模型的生物医学语义关系抽取的方法。针对不 区分类别的蛋白质相互作用这种宽泛定义的关系抽取,提出了一种基于最大熵的二阶段蛋白质相互作用关系抽取方法。针对多类别的蛋白质相互作用这种具体定义的 关系抽取,提出使用最大熵模型结合词特征的抽取方法,该方法在一个具有10种蛋白质相互作用类别的数据集上取得了的总体精确率。同样的方法应用 到疾病与治疗方式关系抽取任务中,也取得了很好的实验结果。此外,本文还通过理论分析和实验对比,从理论和实践两个方面说明了判别式模型比产生式模型更适 合生物医学语义关系抽取问题。参考文献 [1] 王浩畅,赵铁军. 生物医学文本挖掘技术的研究与进展[J]. 中文信息学报. 2008(03) [2] 于中华,陈蓉,胡俊锋,陈源. 基于加权投票K—近邻法的生物医学缩略语消歧[J]. 中文信息学报. 2008(02) [3] 龙军,殷建平,祝恩,赵文涛. 主动学习研究综述[J]. 计算机研究与发展. 2008(S1)

生物制药论文开题报告

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一、研究背景

20世纪初才在我国大量栽培。洋葱中含有丰富的黄酮类化合物，而黄酮类化合物在医药和食品中有着广泛的应用。

黄酮类化合物具有抗癌、抗心血管老化、抗炎、杀菌及降血压等作用。有报道说，洋葱中主要的类黄酮是黄酮醇懈皮素及其衍生物，其含量达总黄酮含量的80%以上，由于含有酚烃基结构而具有较强的抗氧化作用，许多药理学研究表明，懈皮素具有比其它类类黄酮更强的抗氧化性、清除自由基活性、抑制脂肪氧合酶和环氧化物酶，防止血小板凝集的作用。

由于洋葱具有多种保健功能特性，其精深加工产品蕴涵着巨大的市场。因此，对洋葱的深入研究将会为降血糖、降血脂、抗血栓、抗菌抗癌等天然药物的开发利用提供新的线索。

目前对洋葱的研究主要集中在含硫化合物上，而对其黄酮类化合物提取、应用开发技术方面的研究报道甚少目前，国内也几乎没有真正意义上的洋葱深加工产品，其加工水平和产品处于脱水等较低水平。

例如:洋葱干和洋葱粉，以及洋葱沙拉酱等。而在发达国家开发出洋葱黄酮胶囊、洋葱方便食品等多种既具较强保健功能又方便、营养可口的深加工产品。

因此通过高新技术应用和提取工艺的优化从洋葱中提取黄酮类化合物，能够提高原料的利用率，提高产品的附加值，有利于经济效益的提高。我国加入WTO后，因包括劳动力在内的生产要素低廉，所以洋葱等原料在国际贸易中具有明显的外贸比较优势。多年来中国洋葱产业主要以原料或初级加工产品面向国际市场。

目前，我国洋葱及其制品的生产和销售受到三个方面的制约:第一，原料形式出口和销售受市场因素制约较大，且价格较低，附加值低;第二，应用领域不宽，出口价格波动较大，导致产品积压，同时又反过来影响了种植和加工;第三，加工品种类型单一，销售一市场单一。

以上三方面的影响导致其价格不稳定，收入不稳定，极大地影响了我国洋葱产业的发展。尤其是洋葱产业普遍存在产品结构不合理、品种单一、生产上艺水平低、呈现主要药理功能作用的风味物质提取率及在产品中的含量低的缺点，难以创造高技术含量、高附加的适应市场需求的新产品，严重影响了产业的进一步发展。而洋葱高品质、高价值的贸易品越来越受到食品工业的推崇，在国外发展迅速，己逐渐成为食品工业的主要原料之一，这些在我国则刚刚起步。

我国面临全面与国际接轨后更加激烈的国际竞争，这迫切需要洋葱产业要有较大的发展。我们必须积极增加人力资本和技术投入，不断增加知识产品的生产，依靠洋葱原料外贸比较优势构建我们的产品竞争力。

通过本实验的研究，一、可以为充分有效开发和利用洋葱功能性成分奠定基础、提供必要的依据。洋葱的深加工和功能食品的研究开发要建立在其功能性成分深入细致的研究基础上。

而国内外虽在这方面做了很多工作，但仍有很多需要进一步研究和实验的内容。通过本实验研究期望能在这一方面有所贡献。二、提高洋葱的附加值，为广大种植户带去更多的实惠。

开发洋葱深加工产品，为培植洋葱育种→种植→贮藏→运输→深加工→包装→营销的产业链，带动和发展一方产业。在提高洋葱附加值和经济效益的同时带来社会效益，为广大农民种植户提供发家致富的机会。是解决三农问题，寻求长期切实可行、行之有效的方法和途径。三、有利于产业结构的调整。利用丰富的原料资源，发挥中国生产成本相对较低的优势，开发出适合国际市场所需的深加工产品，完全有可能成为出口创汇的渠道。从而改变我国农产品依赖于原料出口的现状。

二、该选题的研究现状及发展趋势

洋葱品质优良、营养丰富、易于生产管理，作为天然的保健营养食品，一直受到人们的青睐。洋葱由外国引入我国，因此我国对洋葱栽培的时间相对来说并不算长，但是尽管如此，由于洋葱适应性强，又耐贮藏和运输，而我国自然条件十分有利于洋葱的生长，所以，在我国种植历史虽然短，但发展速度很快，现如今它已经成为我国栽培面积大、栽培范围广、产量最高的蔬菜之一。

洋葱同生姜、大蒜一样，都是亚洲国家传统的药食两用植物，含有多种生理活性成分，在保健和预防、治疗慢性病等方面具有多种功效。近年来，随着人们对自身保健意识的增强，日益强调食品原料及添加剂的天然性、功能性，使得人们更加关注洋葱的药食兼用特性，期望提取、富集其生理活性成分，更好的满足人们的.需要。

洋葱中含有丰富的黄酮类化合物，而黄酮类化合物化合物的生理活性作用较为广泛，具有抗癌、镇痛、提高免疫能力等药用保健功能。

在临床上，可以用来预防和治疗脑动脉硬化及脑血管循环不顺畅等疾病。由于注意到洋葱中类黄酮的含量较高，而且类黄酮种类为具有广泛生理活性的榭皮素及其糖甙，美国、日本以及欧洲一些国家对洋葱中类黄酮的研究非常重视。而国内对洋葱的研究主要集中在含硫化合物上，黄酮类化合物、前列腺素类和氨基酸类等的药理研究还有待进一步的研究。

目前国内外主要是从银杏叶、大豆、山植叶、荷叶、芹菜叶、水芹、花生壳等材料中利用有机溶剂、超声波、酶解等方法提取类黄酮化合物，为了进一步提高类黄酮的质量，将类黄酮产品推向广阔的市场，有必要寻求更多的原料及合适的提取方法以及研究最佳的提取工艺条件。

三、主要研究内容及预期目标

主要研究内容

回流法提取洋葱皮总黄酮的工艺流程如下:

洋葱皮洗净→烘干粉碎(过60目筛) →回流提取→提取液→抽滤→离心→总黄酮粗提液→真空干燥→黄酮粗品

1.洋葱中总黄酮提取液的定性检测：通过盐酸一镁粉还原反应、金属盐类试剂的络合反应、提取液与浓硫酸的反应以及与NaOH水溶液的反应等颜色反应确定洋葱提取物中确实含有黄酮，

2.洋葱中总黄酮提取液的定量检测：通过芦丁-分光光度法测定洋葱中总黄酮含量。产品中黄酮得率可由下式计算，黄酮得率E(%)为:

式中: c一洋葱皮总黄酮提取液的浓度(mg/ml)

V一洋葱皮总黄酮提取液的体积(ml)

N一稀释倍数

M一原料质量(g)

3.粉碎粒度对黄酮得率的影响: 准确称取粒度为20目、40目、60目、80目的洋葱粉末各1g，分别加入80%的乙醇溶液20ml，在70℃温度下一次回流提取2h，二次回流提取lh，合并提取液并抽滤，滤得清液在500Or/min条件下离心8min，然后定容于5Oml容量瓶中。分别准确吸取lml样液，按建立标准曲线的方法进行吸光度A的测定，从而得出黄酮类化合物的得率。