当前位置：学术参考网 > rnaseq经典论文
摘要转录组测序（RNA-Seq）作为一种新的高效、快捷的转录组研究手段正在改变着人们对转录组的认识。RNA-Seq利用高通量测序技术对组织或细胞中所有RNA反转录而成cDNA文库进行测序，通过统计相关读段(reads)数计算…
在RNA-seq项目中，常见的结果包括：火山图、韦恩图、聚类热图、log2(ratios)折线图、有向无环图、散点图、代谢通路图、蛋白互作图等。今天我们先来一起学习火山图、韦恩图、聚类热图和折线图的解读。1、火山图RNA-seq中，火山图（VolcanoPlot）显示了两个重要的指标：foldchange和校正后的pvalue...
转录组入门（2）：读文章拿到测序数据本系列课程学习的文章是：AKAP95regulatessplicingthroughscaffoldingRNAsandRNAprocessingfactors.NatCommun2016Nov8;7:13347.
通过链特异性RNA-Seq建库，对下机rawdata进行过滤后，75.20–86.60%cleanreads能够比对上山羊参考基因组（CHIR_1.0,NCBI）。再通过生信流程分析鉴定到3515个intergeniclncRNAs（88.29%）和466个anti-senselncRNAs（11.71%）转录本，对应2739个lncRNAgenes。
单细胞测序技术这么热门，我们肯定不能错过，特此总结了8篇文献让童鞋们更好了解研究它：.1、NatRevNephrol杂志上今年5月22号发表的综述，主题是单细胞RNA测序在发育、生理和疾病研究中的应用，主要介绍了单细胞测序技术的流程、不同单细胞捕获方法...
在本研究中，研究人员联合使用了单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RNAscope多重荧光检测技术、类器官培养、细菌感染模型、寄生虫感染模型和其他技术，揭示了ISCs与Th细胞的相互作用以及对于肠上皮细胞维持的影响。.发现了一类表达MHCII的ISCs具有向辅助性T...
该论文利用大规模mRNA原位杂交和RNAseq技术，首次构建了小鼠海马基因表达精细图谱（HippocampusGeneExpressionAtlas,HGEA），发现了小鼠海马体四个区域不同亚区域的分子异质性，进一步完善了海马体的经典轮廓，为进一步治疗包括阿尔茨海默症
相关专题随着ncbi数据库各种资源的涌现，NCBI已经成为科研工作者必不可少的资料查找，数据分析的工具。那么NCBI数据如何使用，新手入门一步一步教你认识和使用NCBI数据库。一综合数据库NCBI数据库集美国国立生物技术信息中心(NationalCenterforBiotechnologyInformation)，即我们...
RNAseq文库准备的成功依赖于每个阶段的精心控制，本文介绍创建RNAseq文库的前两个阶段(步骤1-3)。.1)RNA分离.2)RN段化.3)反转录.4)cDNA高通量(下一代)测序.5)insilico序列比对.起始物的准备.与任何大规模、多阶段的实验一样，起始材料的质量至关重要...
通过接触很多的客户,发现许多老师,在我们这里做了RNAseq实验,希望先对RNAseq的数据进行分析,整理,希望纯数据分析或者稍加验证就可以发表文章,虽然这类文章看过很多,但没有总结明确...
通过接触很多的客户,发现许多老师,在我们这里做了RNAseq实验,希望先对RNAseq的数据进行分析,整理,希望纯数据分析或者稍加验证就可以发表文章,虽然这类文章看过很多,但没有总结明确...
总的来说，基于scRNA-seq构建的基因调控网络可以帮助研究人员解析瘤內异质性并鉴定关键基因。流程图1.数据的获取和整理本文从GEO数据集下载包含6个TNBC的scRNAseq数据（GSE11...
这是一篇在NC上发表的使用RNAseq工具对比的一篇文献,解读这篇文献对我们使用RNAseq发文提供了思路。下面小编具体解说一下。文献摘要:RNA-sequencing(RNA-seq)是一个重要的转录组...